研究目的一节叙述论文的研究问题和主论点,本文则是说明如何去论证主论点。主论点往往不能直接验证，而要延伸成二级或三级“论点树”,论点树的末级假设即操作假设。以实证为主的专业学位论文,一般能够实证1 ~3个操作假设就可以了。论文结构这一节要解释从主论点到操作论点的转换过程和理由。
以《勤劳而不富有》一文为例，主论点是制度成本对冲了人力资本的价值。
“论文结构”这一节就要解释,为何要从交易所费时间、交易障碍和第三产业比重去比较交易制度不完善与交易制度完善国家之间的差异。进而说明交易障碍从企业注册所需批准机构数、注册费用，注册起点资金等指标去测量的理由。最后总结出论点树中的5个操作论点:交易制度不完善与交易制度完善国家相比,交易所费时间要长;注册时间要长;注册费用要高;批准机构数目要多;第三产业比重要低。首尾两个论点属于论点树的第二层,其他处于第三层。
假设转换和变量设计是整个研究工作创新性的实质性内容，是论证部分必须交代的内容,不可忽视。
对于各个操作论点,可以通过不同方式来论证,包括引用前人已有研究成果;用理论推理方式证明;用经验验证的方法来论证。以实证为主的专业学位论文,能够用数据和事实实证一两个论点就可以了。《勤劳而不富有》一文的5个操作论点,作者运用了不同的论证方法。第1个论点,交易所费时间,从常识出发推理论证;第2~4个关于“注册时间”“注册费用”和“批准机构数”的论点，均引用文献中已有的研究结果和数据,作者用现有统计数据进行经验论证的只是第5个,关于“第三产业比重”的论点。
操作论点厘清以后,便要根据各操作论点的论证方法划分章次。论证方法不外乎三种:引用文献现有研究结果;理论推理论证;经验论证。经验论证部分最能反映研究生的研究工作能力,也是论文工作的主体部分,章次划分应凸显这部分内容。可以将引用文献和理论推理论证的操作论点都放在一章内写完 ,接下去写经验论证的操作论点。经验论证的操作论点,如果收集和分析数据的方法和来源相同,便归入一章,如果不同,每个操作论点论证内容可以单独构成一章。
论文结构这节的最后一段,可以用框图形式显示各章次,并用文字解释各章之间的逻辑关系。
绪论章的内容可参考图10-1的顺序来写作。一般来说,专业学位论文这一章的字数在4000 ~7000字。
