（2）大企业内部存在的税收风险。
①大企业集团决策中存在的税收风险
大企业集团的战略决策都是由企业的决策层做出的，但大部分大企业决策层在制定整个企业的重大战略规划时，基本都是从企业的盈利性，可持续发展性考虑决策，很少从税收的角度考虑决策，很可能导致一项决策存在税收风险。
大企业的特点表明，大企业大都为跨地区经营的企业。但企业的决策层只集中在集团总部的注册地，如果各地区税务机关在执行一项税收政策上的松紧度存在差异，那么也可能导致即使一项决策在总部注册地不存在税收风险，但在各地的分支机构中存在税收风险的现象。
②大企业内控机制中存在的税收风险
税收风险与大企业的内控机制是否完善息息相关。企业内控制度是否健全，内控制度执行是否完全，直接影响着税收风险是否能被及时发现以及消除。企业的内控制度包括了企业生产经营的各个环节，如采购环节、生产环节、销售环节、财务环节、投资环节等等，虽然在各个环节中并不是所有内容都与税收有关，但这些环节中与税收有关的内容如果都包含在企业的内控制度中，那么企业的税收风险就会降低。
③大企业员工中存在的税收风险
大企业中税收风险的控制，大部分企业都是交给了财务部门负责。由财务部门负责制定并监督执行内控机制中有关财务与税收风险的制度。因此某个企业内控机制中对税收风险的防范制度是否健全，完全取决于企业财务人员的业务素质。如果财务人员业务素质不高或即使业务素质高但在制定内控机制时把重点放在财务内控机制而不重视税收风险的防范的话，就会导致企业存在税收上的风险。
同时企业税收风险的内控制度是由财务人员负责监督执行，但财务部门与其它业务部门的平级业务关系，也可能导致某些税收风险内控制度执行不力，从而导致企业存在税收上的风险。
2.2.4大企业税收风险管理的内涵
税收风险管理，是指以最小的税收成本为代价降低税收流失的措施和方法。税收风险管理的过程也是包括4方面内容，即风险识别、风险分析、风险评估和排序、处理和评价。大企业税收风险管理也就是通过上述4方面的内容，及时发现大企业税收风险，并对这些风险及时做出处理与调整，达到以最小的成本为代价降低大企业税收风险的目的。
大企业税收风险管理既应包括对大企业内部税收风险的管理也应包括对税务机关内部税收风险的管理。
2.3开展大企业税收风险管理的必要性
伴随着近年来国内经济的不断增长，我国的大企业也在不断的发展壮大。
在大企业不断开设分支机构以及拓宽发展领域的过程中，必然伴随着各种风险的出现，这里面就包括税收风险。国家税务总局大企业司成立后，于2009年颁布了《大企业税务风险管理指引（试行）》，这反应出了税务机关已经意识到了加强大企业税收风险管理的必要性。
2.3.1税务机关对大企业实行有效管理的必然要求
大企业的企业规模都很庞大，组织结构非常复杂，在税务部门人员不多的情况下如何能够更好的对大企业的涉税问题加强管理，使税款流失最小化，是大企业管理部门面临的现实性问题。开展大企业税收风险管理，对纳税遵从度高的大企业实行自我管理为主，对纳税遵从度较低的大企业实行纳税稽查为主的管理，可以把税务机关现有的人力、财力和技术资源最大化的利用，收到事半功倍的效果。
2.3.2可以使税务机关公平与平等对待纳税人
开展大企业税收风险管理，根据企业风险的大小对企业实行不同的管理手段，可以避免以前税务机关对纳税人产生固有的主观判断。虽然大企业整体的纳税遵从度很高，但很多税务人员还是有一种固有的认识，就是国有企业的纳税遵从度高，私营企业的纳税遵从度低。虽然这种判断有一定的根据，但这毕竟是税务人员的一种主观上的判断，以此为理由认为私营企业的纳税遵从度低，税收风险高，这是对私营企业一个极不公正的对待。开展大企业税收风险管理，企业无论性质，在管理中只看风险的高低，可以使税务机关对纳税人一视同仁，使企业能够得到公平的对待。
2.3.3可以提高大企业税收管理的效率
大企业的业务大量且复杂，导致其涉税事项也多且杂，如果对大企业的每一个涉税事项都要严格审查的话，会浪费税务机关很多的人力和物力，严重影响税务机关的工作效率。税收风险管理则是通过对税收风险因素的识别，分析税收风险的成因，确立风险等级，估测可能造成的税收流失、形成税收管理责任等后果，从而有针对性的采取措施，实施监督控制，防范并减少风险带来的损失。这样有针对性的管理，可以大大提高税务机关对大企业进行税收管理的效率。
2.3.4可以降低征税成本，减少不必要的损失
虽然大企业的税收遵从度高，信息化及内控机制都比较完善，但是由于企业规模过于庞大，很难保证企业在任何一个涉税事项上都会准确无误，因此大企业也会存在税收流失的风险。同时相对于中小企业来说，大企业可能一个小的疏漏所流失的税款要比中小企业故意偷税所流失的税款要多。对大企业实行税收风险管理，税务机关可以对大企业征税过程中税款流失的风险进行识别和预判，对存在的风险实施有效的事前控制，同时也包括处理风险后果等一系列的活动。这样不但可以降低税收成本，也可以最大限度地防范税收流失。
2.3.5可以帮助企业完善内控机制，提高税收遵从度
大企业普遍税收遵从度都很高，但由于大企业自身内控机制特别是与税收相关的内控机制的不完善，可能会使大企业产生税收风险，从而使自身的税收遵从度下降。对大企业进行税收风险管理，当发现企业的风险点时也就相应发现了企业内控机制可能存在的漏洞。税务机关可以协助企业修改和完善这些税收漏洞，这样不但可以使企业降低漏税的风险也提高了大企业自身的内控机制和风险防范机制。从而使大企业的税收遵从度进一步的提高。以大连市为例，2008年总局下发了《国家税务总局关于加强非居民企业来源于我国利息所得扣缴企业所得税工作的通知》（国税函[2008]955号）。文件规定"自2008年1月1日起，我国金融机构向境外外国银行支付贷款利息、我国境内外资金融机构向境外支付贷款利息，应按照企业所得税法及其实施条例规定代扣代缴企业所得税。"文件下发后，大连市国家税务局直属分局（该局为大连市国税局大企业管理局）在分析金融企业申报数据时未发现有该项扣缴内容，经到各银行核实，银行的境外拆借业务是国际业务部处理，并不经过财务部门，因此财务部门并不知道银行有此项业务，各银行在税务部门的帮助下不但自行核实应缴纳税款，也纷纷修改内部业务流程以防止此类事项再次发生。
2.3.6可以提高税务机关的纳税服务水平
大企业司成立的初衷之一就是对大型企业集团实行扁平化管理，提高对这些企业的纳税服务水平。目前税务机关对企业的纳税服务尤其是对大企业的纳税服务已经不局限在为企业提供便捷、舒适的申报环境，纳税服务包含在税务机关对大企业进行税收管理的各个环节。因此对大企业进行税收风险管理，帮助企业提高防范税收风险的能力，是税务机关在大企业税收管理工作中所特有的服务，也是税务机关高水平高层次的纳税服务。
2.3.7可以使税务机关对大企业的管理更为规范
税务机关对大企业的管理的规范化程度，也会导致大企业税收风险的升降。因此税务机关对自身进行风险管理，可以识别出目前税务机关在对大企业的管理中存在问题，税务机关可对这些自身的问题进行及时的调整，以避免由于税务机关的原因导致大企业税收风险的变化。从而使税务机关对大企业的管理更加规范。
