（1）许多操作人员在输入“E 证通”数字证书的密码时，一旦输入错误就会反复尝试，由于“E 证通”数字证书有一个自我保护机制，连续输入密码错误五次就会导致“E证通”数字证书锁死。它的解锁需要 1-2 个工作日，这段时间里，操作人员就不能登录系统办公，正常的业务就无法顺利开展，这极大的降低了工作效率。如果该事件发生在服务型窗口单位，造成的损失更严重。
（2）部分操作人员在业务办理过程中操作不当或者错误操作，会对业务办理人造成影响。通过电子政务的方式处理业务，其中的错误更加隐蔽，一旦造成了损失，几乎无法挽回，而且现在法律层面的责任认定尚不完善，业务办理者很难获得补偿。究其原因，一方面是对“E 证通”数字证书的推广方式不够循序渐进，部分操作人员囫囵吞枣；另一方面是部分公务员缺乏一定的科学文化素养，尤其是年龄相对较大的公务员计算机水平低下。
2.2.2 日常使用的管理规定不明确
在青岛市“E 证通”企业数字证书使用的过程中，无论是政府机构还是各大企业，都缺乏一个有效的使用管理规定。
首先，“E 证通”企业数字证书一旦丢失、损坏，可能会造成很大的后果。 “E 证通”企业数字证书具有极高的安全性，但它是存放在类似 U 盘的一种移动存储介质内，犹如个人身份证明的电子版。一些使用人员会误认为它是 U 盘一类的存储工具，随意放置、携带，一旦证书被误格式化，或者由于水、火、电等原因损坏，甚至丢失，而重新制作需要经历相当严格的审批过程，那么在一定时间内，轻者业务办理会受阻，严重者可能会遭到盗用，后果不堪设想。
其次，缺乏对“E 证通”企业数字证书的日常使用管理规定。许多企事业单位仅仅是作出了对数字证书发放、撤销和制作的规定，并没有涉及到数字证书发放后在日常业务操作中的相应管理规定。例如，随意借用“E 证通”企业数字证书，这会导致许多原本需要多人参与的业务流程由一个人来完成。这种情况体现在，一是政府部门领导事务繁多，无法及时使用“E 证通”企业数字证书确认工作流程，只好交由下属代为完成；二是企业里财务出纳混用“E 证通”企业数字证书，导致公司财务安全出现隐患。另一种常见的管理问题是对不在岗位的工作人员其数字证书的协调问题，若某部门工作人员休假或出差，替岗人员没有该类权限的数字证书，也将无法办理日常业务。
“E 证通”数字证书是一种新兴事物，而且涉及到方方面面的重要工作，作为政府机关更应当及时制定其使用规范。而由于目前缺乏对“E 证通”企业数字证书在日常业务中使用管理的规定，极易引发上述各种问题，并且事后在责任认定和追究上都将难以界定。
2.3 电子政务网站的整合度不够高，缺少统筹监督
2.3.1 电子政务网站整合度不高
目前，尽管青岛市 19 个部门涉及办税、企业年检、审批等 225 项管理和服务事项能够使用数字证书实现网上办理，但是“E 证通”企业数字证书作用的深度不够，以青岛市工商局为例，企业以用户名/密码方式或数字证书登录的方式进行网上年检，网上年检的流程大致为：用户从工商网上年检系统填报相关表格，进行预审。待预审通过后下载打印年检报告书，并携带相关材料、营业执照等到相关部门进行复核，完成年检。在这一流程中，“E 证通”企业数字证书起到的作用仅仅是登陆时的身份验证。而且企业的“无纸化年检”并不完全“无纸化”,事实上在企业完成网上年检后，仍需到工商局现场递交纸质年检材料。相较于国内一些成熟的工商局，如深圳、广州、福建等，许多创新的应用如网上贴花、电子营业执照、电子签章等还需要逐步开发和完善。
内部网络一网式办公和外部网络一站式服务的理念，是青岛市构建电子政务的统一理念和思想保障。在职能方面，政府的转变方向是构建服务型的政府。由上述可知，电子政务必然是将网上一站式的服务当做主要的目标。为了构建内部网络一网式办公模式，政府要加强各级别管理部门交换信息资源，共享对外信息的力度，实现便利的沟通和合作，提高管理和行政效率。青岛政府与市委狠下决心，在十多年的建设中在全市的范围内将金宏电子政务系统统一推广。通过逐步深化和拓展，金宏电子政务系统在信息编辑、公文流通、电话管理，接待管理、监督考核、议案采集、接收邮件、人民来访来信的管理、领导活动的管理、会议的管理等各种办公的业务逐步得到完善，逐步成熟起来。然而，部分的部门现阶段依旧忽视了金宏电子政务在办公方面的快捷便利优势，仅仅是将该系统当做一种传输文件的工具，相应的应用没有得到有效利用。在应用的基础上拓展电子政务是必要的途径，将管理，信息和服务三者统一结合在一起是必要目标。电子政务并非要建设大规模的网络基础设施，而是在实现相关应用功能的基础之上，加强电子政务框架体系的拓展，显而易见，应用功能的实现才是重中之重。
青岛市的电子政务日趋成熟，但是仍缺少创新的灵魂。电子政务在将政务电子化的过程，并不是一个复制的过程，而是一个优化再加工的过程。许多纸质流程照搬到电子流程之后并不适用，而且会出现一些不必要的步骤，这个时候就需要流程上的创新。同样，在实际的政府工作中，还有许多没有流程化的业务都可以通过创新来加以改变。
2.3.2 贯彻应用随意，缺少统筹监督
青岛市电子政务系统推行“E 证通”企业数字证书电子签名认证，是利用信息化手段优化服务的重要举措，也将带来政府日常服务工作的变革。虽然青岛市政府、事业单位系统上下统一了思想，统筹组织，积极稳妥地推进此项工作，但是此项工作与各企业密切相关，必须在企业自愿的前提下进行，推行起来有一定的难度。既要积极引导企业采用数字证书方式办理网上的各种业务，又不得强制推行。因此，推行工作缺少政府的统筹管理和过程监控，具体贯彻实施部门在应用中显得比较随意，压力不是很大。
根据青岛市信息产业局、青岛市电子政务办公室《关于企业和个人网上数字证书发放和应用问题的公告》，“E 证通”企业数字证书可分别向组织机构和个人发放，但必须坚持用户自愿原则。任何单位都不得以任何方式强制用户购买。
“E 证通”企业数字证书在推行之初，由于政府部门比较重视，曾有一段时间大力推广，许多业务窗口甚至会把推广介绍“E 证通”企业数字证书作为一项工作指标，“E证通”的办理数量也直线上升。但是由于网站功能的整合度不够高、用户认识度不够等原因，其推广效果也逐渐下降，最终回归理性。由此导致政府部门推广的积极性受阻，对“E 证通”企业数字证书项目产生不利影响。
2.4 “E 证通”数字证书能否保持与时俱进
在信息科技飞速发展的今天，任何事物、任何人都需要保持与时俱进的精神。同样，作为国家支柱的政府更要做到与时俱进。因此，电子政务这一政务与互联网技术相结合的产物也要顺应时代的潮流而进步。
近几年来，随着“金桥”、“金卡”、“金关”、“金税”、“金盾”等国家级工程的建设，青岛市的电子政务快速发展。这对加快工商、海关、税务、公安等政府职能部门的电子政务步伐起到了重要作用。但是，电子政务的发展也需要扎实的根基，要处理好“电子”与“政务”的矛盾和统一。对于青岛市“E 证通”企业数字证书也是如此。
2014 年 2 月 19 日，国家工商总局决定，自 2014 年 3 月 1 日起停止对领取营业执照的有限责任公司、股份有限公司、非公司企业法人、合伙企业、个人独资企业及其分支机构、来华从事经营活动的外国（地区）企业，及其他经营单位的企业年检工作。
工商总局要求各级工商部门，抓紧做好企业年度报告公示制度等一系列新制度的实施准备工作；结合本地企业和经济发展实际，进一步加大监管力度，依法查处各类违反企业登记管理法律法规的行为，切实履行监管职责[23].根据国务院新近出台的《注册资本登记制度改革方案》，企业年度检验制度改为企业年度报告公示制度；改革个体工商户验照制度，建立符合个体工商户特点的年度报告制度；探索实施农民专业合作社年度报告制度。
截止到 2014 年 3 月 1 日，我国之前所实行的企业年检制度对于各类市场来说，都是一个不大不小的负担，特别是一些连锁企业，有多少家门店年检时就要跑多少趟，全办下来需要花费相当长的时间和精力。实行企业年度报告公示制度后，企业无需再到工商部门提交书式资料，仅需登录市场主体信用信息系统，并根据提示填写相应项目即可自行完成年度报告信息申报操作，便利性大大提高。
该项政策的出台也预示着青岛市工商局网上年检功能需要巨大的革新。然而，在新政实施之前，青岛市工商局网上年检系统仍然不完善、不成熟，在此基础上变革核心功能前途未卜。对于“E 证通”来说，也需要配合工商局进行功能上的升级和改造，这对于刚刚培育的客户群体也是一个不小的冲击。
此外，建设电子政务属于高科技的工程之一，不管是最早的决策还是在以后的日常管理方面，都需要充分的对专业的人才加以尊重与依靠。现阶段严重的缺少兼顾电子技术和市政知识的人才，也缺少能够长期性，有效性和系统性进行培训的传递机制，两种缺失造成了如今落后的电子信息技术和人才的空缺的局面。目前最短缺的既不是懂得电子信息技术的人才，也不是单独了解政务的知识分子，而是缺少两方面相结合和互补的复合型人才，不将有效培养机制建立起来，这类人才很难出现，这就无法适应电子政务的发展要求。
青岛市政府相对来讲还是比较缺乏能够追上信息化快速发展的步伐的复合型人才。所以要想建设信息化的部门单位和系统，就要提高主管信息化领导的决策性。如果领导对电子政务有深刻的理解就能更好地进行信息化建设，作为领导既要具有传统的人文知识，也要注重对管理政务知识、电子信息知识和应用知识的摄入。如此才可以较准确的认识到本部门、本单位电子政务的规划与实施。同样，青岛市“E 证通”企业数字证书也亟需这种复合型人才，以致力于政府转型时期电子政务的建设。
