事业单位部门决算是指在每个会计年度终了，以日常会计核算为基础，汇总全年收入、支出、资产、负债、人员等方面的各项基本数据，并且根据财政部门决算编审的要求，系统地、真实地、全面地反映事业单位各项财务收支状况和预算资金的执行情况。通过编制事业单位部门决算，可以满足国家对事业单位财务会计监管的需要；通过对决算数字进行科学地分析，既可以为上级部门进行宏观决策提供重要的参考资料，也可以为本单位下一年度预算编制提出改进意见，从而提高下一年度预算的编制水平。
一、当前事业单位部门决算编制中存在的问题有
(一)部门决算编制时间短、工作量大
事业单位编制决算时，通常要求春节前完成，而春节一般在1月底或2月初，大概只有1个月的编制时间。而编制部门决算前还要对基础账务进行审核、检查，对暂收暂付款项进行针对性地整理、催收，对固定资产的实物进行清查并和帐薄登记数相核对，还要保证新一年的财务日常业务不受影响，同时，在新旧年份交接之时，还有其他与会计无关的事情需要处理，比如单位的年终总结、评比先进等工作。而且在编制部门决算前，财务人员还要和财政部门、上级主管部门、下属基层单位进行对账。主管部门不仅要编制本级的决算报表，还要负责本系统决算单位的对账和报表的审核、汇总工作，增大了主管部门的工作量，在对账过程中，如果和财政部门、主管部门出现不一致时，就会大大延长对账时间。面对如此剧增的工作量，还要在规定时间内完成，往往会出现只要决算能够顺利地通过审核，在规定时间内能把部门决算报送出去，哪怕出现拼凑数据也无所谓的情况。
(二)对部门决算的认识不到位
对部门决算的主观认识还停留在一个浅表的层面，认为事业单位部门决算只是在年度终了之后，对财务状况和资金使用的一个简单汇总，仅仅起到了年终后整体算账的作用。再加上填报的时间短、工作量大，在编报过程中，遇到编报说明没有明确规定的情况时，就以编审能够通过为前提或是出于对来年预算的考虑，不按规定的口径进行填列，违反了决算编制的严谨性和一致性的原则。
(三)会计核算方法使得帐表不符、报表失真
目前，财政部门要求预算单位必须量入为出，也就是所有的支出项目都要有相对应的资金来源，以此做到决算平衡。因此就会出现当实际支出大于财政拨入的收入时，对大于收入的那部分支出，单位要么年终不予结账，采取隐瞒超支或延期结算等方法转接到下一会计年度；要么虚增往来款项，人为地做到了收支平衡。在施行国库集中支付后，有些事业单位会计还习惯于把资金从财政账户划拨到自有账户，由于部门决算是站在财政角度编制的，对财政部门来说，财政资金减少了，即便是决算单位一分钱也没有从自有账户中支付出去，在编制决算时这部分资金也要视同支出，由此就导致了帐表不符的情况。
二、提高部门决算编制质量的建议
(一)加强编制部门决算的认识
部门决算是对预算单位全年财务收支状况和资金使用情况的一个综合反映，是事业单位预算执行结果的体现，也是对事业单位预算编制的合理性的一个检验。一方面财政部门希望通过部门决算的数据，从宏观方面了解各行各业、各部门的收支状况，从而明确财政资金投入的方向和重点，从微观方面甚至可以掌握一个单位的收支状况和机构运行情况，审查其支出的合法性、合规性，从而实现对基层单位经济业务的监督。另一方面决算单位通过对本部门决算数据进行分析，可以看清本单位的现状，发现存在的问题，为单位制定相应的政策和措施提供基本的依据。
(二)夯实会计基础工作
所谓会计基础工作是指会计日常工作的基本业务。会计基础工作的好坏直接影响到决算的真实性和决算的质量。具体包含以下几点：
严格按照财务规定对原始凭证进行审核、校验，根据审核无误的原始报销凭单细致认真地录入会计凭证。只有在原始凭证是真实的，会计科目是正确的，支出金额是无误的前提下，才能保证会计信息是准确的，在年终编制部门决算时，既减少了对账的时间，也提高了工作的效率，还能够保证部门决算的精确性。
(三)严格把控部门决算的编审
在编制部门决算之前要认真地学习决算报表的编报说明，了解本年度决算报表的结构，弄清楚决算报表的填报内容，理清楚决算报表的填报范围。对于报表中填列的数据，哪些是直接从帐薄中提取的，哪些是在基础数据上分析、汇总的。只有把报表的各方面情况掌握清楚、明白，才能保证填制的决算报表是真实的、完整的、准确的。
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