3 miRNA与植物的育性
随着miRNA 不断深入的研究,越来越多的研究发现一些 miRNA 与植物花的雌、雄蕊发育密切相关,并且调控花药的开裂和花粉释放,如 miR167,其通过调节靶基因 ARF6/8 行使功能(Wu et al., 2006)。
在拟南芥研究中发现,arf6/8 双突变体与过表达miR167 表型相似,二者都产生发育不完全的花器官和雌雄生殖能力的损坏(Ruetal.,2006;Wuetal.,2006)。
在梅花开花时期,miR167 不同程度的调节其靶基因,当雄蕊中花药和卵细胞扩散完全,miR167 表达明显减少,表明 miR167 家族也许是梅花(P. mume)发育所必须的(Wangetal.,2013)。拟南芥中对 InARF8 动态研究发现,InARF8 转录水平在雌蕊生长阶段增加,达到最高水平是在花开放时,在雄蕊中 mRNA积累达到最高水平是在生长第 3 阶段(Nagpal et al.,2005),同时成熟的 miR167 在雄蕊中的积累量高于雌蕊,且雄蕊中的最高积累量也是在生长第 3 阶段;ARF6/8 在雌蕊中出现,为花粉萌发提供条件,同时在胚胎和胚珠原基也有 ARF6/8 (Wu et al., 2006);ARF8 也在柱头突起上大量积累;在单突变体中ARF6 或 ARF8 功能的丢失,推延了雄蕊丝的伸长和花粉的释放,限制了授粉(Nagpal et al., 2005);Arf6/8双突变体的雌蕊不能诱导花粉萌发,所以说拟南芥中ARF6/8 在花中调节了雌雄器官的发育。过表达miR167 的拟南芥花中出现了萼片、花瓣变短,花药不开裂,这些表型与 arf6/8 双突变体相似,表明 miR167通过影响 ARF6/8 活动,调节植物的发育过程。
在 拟 南 芥 中 miR159 由 miR159a、miR159b、miR159c 组成,大量生物信息学和分子生物学预测这个家族可能有 20 或更多的靶基因,其中 12 个在花粉或花药中表达或与它们的发育有关.在山核桃、梅花、桃中均有 miR159 的发现(Wang et al., 2012;2013; Galla et al., 2013),桃中 miR159 在所有的组织中均有表达(Galla et al., 2013);苹果中 miR159 的靶基因为 MYB,其与花粉和花药发育有关,miR159 调节雄性器官的发育和生长(Xia et al., 2012);而在梅花中发现了 miR159、miR160、miR393 等连同 AG、LEA、XTH2、PPME1 与雌蕊的发育有关(Wang et al., 2013)。
miR159 家族与 miR319 家族相关,由于序列的不同阻止了 miR159 调节 miR319 靶基因(Palatnik et al.,2003; 2007)。miR159 调控的 MYB33 和 MYB63 是正常花器官生长和发育所必须的,MYB33 和 MYB63突变体导致雄性不育(Allenetal.,2007;2010)。
miR159、miR167 和 miR319 三者相互作用调节花器官发育,miR319 表达量的减少导致花瓣短而细长、雄蕊发育不完全、花型小,甚至出现花瓣和雄蕊丢失,过表达 miR319 推延花期,并引起雄性不育(Nag et al., 2009; Todesco et al., 2010)。在梅花中,miR319 在雌蕊数目减少或丢失的不完整花中较正常花上调,miR319 通过调控靶基因 ARF6/8 来调控雌蕊数量,表明 miR319 与雌蕊发育有关(Wang et al.,2013)。miR159 和 miR319 交互调节靶基因,并反过来调控 miR167 家族成员的表达。miR159、miR167和 miR319 通过调节 ARF6/8 活动来调节萼片、花瓣和花药(Nagpal et al., 2005)。miR159 和 miR319 抑制它们的 TF (Transcription factor)靶基因表达,TF 靶基因可能导致 miR167 错误表达。此外,通过 miR159和 miR319 靶基因调节,可能引起 miR167 基因间的互调,如雄蕊中的 miR167c 被 miR167a 抑制。
miR319 有助于 miR167b 活动,使 miR167a 在花梗中被抑制,这些互相作用的方式对花瓣、花药的伸长和成熟都是必不可少的。
miR396 在花中表达,拟南芥中过表达 miR396出现了只有一个心皮的雌蕊,miR396 靶基因 GRF(Growth Regualting Factor)表达水平的减少引起了雌蕊的异常。拟南芥中 GRFS 和 GIFS (GRF-interactingFactors)表达模式与 miR396 呈负相关,GRFS 和 GIFS互相影响形成 GRFS/GIFS 复合物,miR396 抑制GRFS 表达导致 GRFS/GIFS 复合物的减少,GIF 单突变体出现正常的雌蕊,而 GIF 三突变体 GIF1/GIF2/GIF3 出现了不正常的雌蕊,GRFS 和 GIFS 都是雌蕊发育所必须的.在金丝桃研究中发现 miR396家族很可能调控转录因子 UPA17,其与花粉的发育有关(Galla et al., 2013),在其不同生长阶段中,miR396在雌蕊中表达一致,而在花药中表达不同(Galla et al.,2013),miR394 在花药和雌蕊中早期阶段积累高于后期(Galla et al., 2013),在梅花的研究中也发现 miR394在完全花和不完全花中表达不同(Wang et al., 2013),因此可以说 miR394 与雌蕊发育有关。
4 展望
目前,随着分子生物学和生物信息学不断发展,miRNA 的研究越来越深入。克隆测序、Western 杂交、RNA 印记、RNA 酶保护分析、基因芯片以及实时定量 PCR 等技术为 miRNA 深入研究提供了技术保障。miRNA 这种仅有 21~23 nt 大小的片段在植物中从种子的发芽到成年的结束,从地下的根部到地上的顶端分生组织都发挥这巨大的调控作用.而目前综述来看,大部分的研究主要集中在 miR156/157、miR171/172、miR159/396 等部分 miRNA,这表明仍有大部分的 miRNA 有待进一步挖掘。
从文献报道来看,很多科学家开始对植物中与开花相关的 miRNA 展开研究分析,但是对于 miR-NA 这种复杂的调控机制目前还没有深入的挖掘,很多的研究仅停留在某个 miRNA 的作用机制,还没有将其中两个或更多个联系在一起.而 miRNA 这种特殊的片段存在着一个 miRNA 有多个靶基因或一个靶基因由多个 miRNA 共同调控的机制,如 miR159预测有 20 多个靶基因,ARF 基因受 miR390、miR167等调控,意味着 miRNA 中存在着复杂的调控网络。
如果将其放在一起共同研究其调控途径,最终使得miRNA 的研究形成一个系统的网络。木本植物miRNA 的研究较为深入,尤其是杨树、葡萄、苹果等在这方面的研究,目前在山核桃上的 miRNA 研究也逐步推进,不仅有从保守 miRNA 及新 miRNA 的挖掘,也有 miRNA 的降解及 3 端的修饰研究(Wang etal., 2013)。因此,为了更深入地了解 miRNA 在植物中的作用机制,选择适当的木本植物对其 miRNA 进行深入研究,对整个植物中的 miRNA 作用机制深入分析很有必要。
致谢
本研究由浙江省自然科学基金杰出青年项目(LR14C160002)、国家 863 项目(2013AA102605)、国家自然科学基金(31170637)、浙江省农业新品种选育重大科技专项(2012C12904)和浙江省科技厅重大国际合作项目(2011C14010)共同资助。